Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LMOD1P29536 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LMOD1P29536 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LMOD1P29536 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LMOD1P29536 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LMOD1P29536 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
LMOD1P29536 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
LMOD1P29536 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LMOD1P29536 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMOD1P29536 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LMOD1P29536 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LMOD1P29536 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LMOD1P29536 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LMOD1P29536 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
LMOD1P29536 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LMOD1P29536 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
LMOD1P29536 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
LMOD1P29536 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
LMOD1P29536 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
LMOD1P29536 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
LMOD1P29536 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
LMOD1P29536 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LMOD1P29536 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMOD1P29536 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LMOD1P29536 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
LMOD1P29536 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMOD1P29536 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LMOD1P29536 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LMOD1P29536 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
LMOD1P29536 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
LMOD1P29536 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LMOD1P29536 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
LMOD1P29536 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
LMOD1P29536 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMOD1P29536 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMOD1P29536 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
LMOD1P29536 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
LMOD1P29536 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMOD1P29536 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
LMOD1P29536 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD1P29536 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LMOD1P29536 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LMOD1P29536 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LMOD1P29536 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
LMOD1P29536 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
LMOD1P29536 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
LMOD1P29536 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
LMOD1P29536 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
LMOD1P29536 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LMOD1P29536 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LMOD1P29536 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
LMOD1P29536 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
LMOD1P29536 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
LMOD1P29536 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMOD1P29536 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
LMOD1P29536 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
LMOD1P29536 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LMOD1P29536 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
LMOD1P29536 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
LMOD1P29536 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LMOD1P29536 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMOD1P29536 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMOD1P29536 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
LMOD1P29536 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
LMOD1P29536 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMOD1P29536 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
LMOD1P29536 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
LMOD1P29536 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
LMOD1P29536 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LMOD1P29536 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LMOD1P29536 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
LMOD1P29536 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
LMOD1P29536 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
LMOD1P29536 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LMOD1P29536 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
LMOD1P29536 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LMOD1P29536 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
LMOD1P29536 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
LMOD1P29536 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMOD1P29536 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMOD1P29536 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMOD1P29536 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMOD1P29536 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
LMOD1P29536 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LMOD1P29536 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
LMOD1P29536 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
LMOD1P29536 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMOD1P29536 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMOD1P29536 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMOD1P29536 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
LMOD1P29536 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LMOD1P29536 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LMOD1P29536 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMOD1P29536 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LMOD1P29536 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMOD1P29536 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LMOD1P29536 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMOD1P29536 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LMOD1P29536 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LMOD1P29536 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms