Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PTGS1P23219 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTGS1P23219 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTGS1P23219 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTGS1P23219 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTGS1P23219 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTGS1P23219 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTGS1P23219 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTGS1P23219 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTGS1P23219 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTGS1P23219 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTGS1P23219 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTGS1P23219 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PTGS1P23219 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
PTGS1P23219 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PTGS1P23219 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTGS1P23219 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PTGS1P23219 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTGS1P23219 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTGS1P23219 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTGS1P23219 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTGS1P23219 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PTGS1P23219 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PTGS1P23219 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTGS1P23219 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PTGS1P23219 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTGS1P23219 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTGS1P23219 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTGS1P23219 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTGS1P23219 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTGS1P23219 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTGS1P23219 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTGS1P23219 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTGS1P23219 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTGS1P23219 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTGS1P23219 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTGS1P23219 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTGS1P23219 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTGS1P23219 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTGS1P23219 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTGS1P23219 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTGS1P23219 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTGS1P23219 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PTGS1P23219 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTGS1P23219 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTGS1P23219 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PTGS1P23219 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTGS1P23219 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTGS1P23219 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTGS1P23219 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTGS1P23219 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PTGS1P23219 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTGS1P23219 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTGS1P23219 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTGS1P23219 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTGS1P23219 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PTGS1P23219 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTGS1P23219 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTGS1P23219 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTGS1P23219 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTGS1P23219 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTGS1P23219 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTGS1P23219 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTGS1P23219 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTGS1P23219 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.68
PTGS1P23219 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTGS1P23219 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTGS1P23219 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTGS1P23219 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PTGS1P23219 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PTGS1P23219 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTGS1P23219 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTGS1P23219 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTGS1P23219 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTGS1P23219 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTGS1P23219 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTGS1P23219 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTGS1P23219 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTGS1P23219 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
PTGS1P23219 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTGS1P23219 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTGS1P23219 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTGS1P23219 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTGS1P23219 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
PTGS1P23219 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTGS1P23219 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTGS1P23219 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTGS1P23219 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTGS1P23219 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTGS1P23219 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTGS1P23219 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTGS1P23219 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTGS1P23219 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
PTGS1P23219 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTGS1P23219 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTGS1P23219 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTGS1P23219 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTGS1P23219 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTGS1P23219 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTGS1P23219 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms