Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NR1D1P20393 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR1D1P20393 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NR1D1P20393 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NR1D1P20393 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NR1D1P20393 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NR1D1P20393 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NR1D1P20393 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NR1D1P20393 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NR1D1P20393 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR1D1P20393 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NR1D1P20393 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR1D1P20393 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NR1D1P20393 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NR1D1P20393 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NR1D1P20393 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NR1D1P20393 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NR1D1P20393 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NR1D1P20393 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR1D1P20393 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR1D1P20393 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR1D1P20393 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NR1D1P20393 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR1D1P20393 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR1D1P20393 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NR1D1P20393 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NR1D1P20393 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NR1D1P20393 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NR1D1P20393 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NR1D1P20393 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NR1D1P20393 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR1D1P20393 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR1D1P20393 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR1D1P20393 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR1D1P20393 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR1D1P20393 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NR1D1P20393 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NR1D1P20393 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NR1D1P20393 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NR1D1P20393 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NR1D1P20393 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NR1D1P20393 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NR1D1P20393 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NR1D1P20393 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NR1D1P20393 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NR1D1P20393 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NR1D1P20393 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NR1D1P20393 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NR1D1P20393 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NR1D1P20393 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NR1D1P20393 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NR1D1P20393 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NR1D1P20393 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NR1D1P20393 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NR1D1P20393 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NR1D1P20393 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NR1D1P20393 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NR1D1P20393 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NR1D1P20393 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NR1D1P20393 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NR1D1P20393 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NR1D1P20393 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NR1D1P20393 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NR1D1P20393 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NR1D1P20393 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NR1D1P20393 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NR1D1P20393 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NR1D1P20393 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NR1D1P20393 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR1D1P20393 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NR1D1P20393 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NR1D1P20393 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NR1D1P20393 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NR1D1P20393 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NR1D1P20393 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NR1D1P20393 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NR1D1P20393 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR1D1P20393 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NR1D1P20393 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NR1D1P20393 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NR1D1P20393 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NR1D1P20393 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NR1D1P20393 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NR1D1P20393 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR1D1P20393 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR1D1P20393 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR1D1P20393 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NR1D1P20393 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR1D1P20393 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR1D1P20393 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NR1D1P20393 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NR1D1P20393 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NR1D1P20393 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR1D1P20393 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NR1D1P20393 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR1D1P20393 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NR1D1P20393 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NR1D1P20393 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NR1D1P20393 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NR1D1P20393 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms