Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB5AP20339 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB5AP20339 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB5AP20339 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB5AP20339 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB5AP20339 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB5AP20339 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB5AP20339 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB5AP20339 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB5AP20339 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB5AP20339 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB5AP20339 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB5AP20339 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB5AP20339 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB5AP20339 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB5AP20339 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB5AP20339 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB5AP20339 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB5AP20339 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB5AP20339 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB5AP20339 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB5AP20339 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB5AP20339 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB5AP20339 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB5AP20339 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB5AP20339 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB5AP20339 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB5AP20339 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB5AP20339 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB5AP20339 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB5AP20339 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB5AP20339 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB5AP20339 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB5AP20339 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB5AP20339 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB5AP20339 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB5AP20339 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB5AP20339 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB5AP20339 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB5AP20339 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB5AP20339 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB5AP20339 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB5AP20339 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAB5AP20339 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB5AP20339 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB5AP20339 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB5AP20339 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB5AP20339 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB5AP20339 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB5AP20339 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB5AP20339 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB5AP20339 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB5AP20339 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB5AP20339 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB5AP20339 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB5AP20339 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB5AP20339 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB5AP20339 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB5AP20339 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB5AP20339 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB5AP20339 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB5AP20339 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB5AP20339 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB5AP20339 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5AP20339 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB5AP20339 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB5AP20339 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB5AP20339 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB5AP20339 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB5AP20339 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAB5AP20339 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB5AP20339 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB5AP20339 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms