Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
TRIM21P19474 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM21P19474 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM21P19474 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM21P19474 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
TRIM21P19474 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM21P19474 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM21P19474 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM21P19474 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
TRIM21P19474 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
TRIM21P19474 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
TRIM21P19474 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
TRIM21P19474 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM21P19474 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
TRIM21P19474 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TRIM21P19474 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRIM21P19474 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRIM21P19474 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TRIM21P19474 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRIM21P19474 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM21P19474 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TRIM21P19474 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM21P19474 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRIM21P19474 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIM21P19474 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TRIM21P19474 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM21P19474 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRIM21P19474 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRIM21P19474 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM21P19474 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM21P19474 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRIM21P19474 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TRIM21P19474 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM21P19474 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRIM21P19474 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM21P19474 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRIM21P19474 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM21P19474 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM21P19474 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM21P19474 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRIM21P19474 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRIM21P19474 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TRIM21P19474 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM21P19474 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRIM21P19474 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM21P19474 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRIM21P19474 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRIM21P19474 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TRIM21P19474 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM21P19474 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM21P19474 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRIM21P19474 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRIM21P19474 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM21P19474 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRIM21P19474 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRIM21P19474 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM21P19474 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TRIM21P19474 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRIM21P19474 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRIM21P19474 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRIM21P19474 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRIM21P19474 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM21P19474 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM21P19474 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRIM21P19474 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRIM21P19474 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRIM21P19474 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM21P19474 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM21P19474 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM21P19474 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM21P19474 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM21P19474 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM21P19474 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms