Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VAV1P15498 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VAV1P15498 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VAV1P15498 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VAV1P15498 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VAV1P15498 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VAV1P15498 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VAV1P15498 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VAV1P15498 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VAV1P15498 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VAV1P15498 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VAV1P15498 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VAV1P15498 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VAV1P15498 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VAV1P15498 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VAV1P15498 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VAV1P15498 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VAV1P15498 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VAV1P15498 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
VAV1P15498 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VAV1P15498 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAV1P15498 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VAV1P15498 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VAV1P15498 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VAV1P15498 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
VAV1P15498 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAV1P15498 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAV1P15498 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAV1P15498 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VAV1P15498 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAV1P15498 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VAV1P15498 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VAV1P15498 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAV1P15498 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
VAV1P15498 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VAV1P15498 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAV1P15498 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VAV1P15498 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAV1P15498 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VAV1P15498 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VAV1P15498 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
VAV1P15498 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VAV1P15498 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VAV1P15498 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VAV1P15498 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VAV1P15498 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
VAV1P15498 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
VAV1P15498 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VAV1P15498 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAV1P15498 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
VAV1P15498 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
VAV1P15498 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VAV1P15498 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAV1P15498 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAV1P15498 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAV1P15498 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VAV1P15498 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAV1P15498 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VAV1P15498 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
VAV1P15498 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
VAV1P15498 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
VAV1P15498 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VAV1P15498 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VAV1P15498 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VAV1P15498 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VAV1P15498 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VAV1P15498 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VAV1P15498 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VAV1P15498 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VAV1P15498 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VAV1P15498 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VAV1P15498 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VAV1P15498 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VAV1P15498 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VAV1P15498 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VAV1P15498 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VAV1P15498 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VAV1P15498 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VAV1P15498 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VAV1P15498 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VAV1P15498 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAV1P15498 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAV1P15498 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAV1P15498 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAV1P15498 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VAV1P15498 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAV1P15498 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAV1P15498 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAV1P15498 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VAV1P15498 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VAV1P15498 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
VAV1P15498 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VAV1P15498 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VAV1P15498 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VAV1P15498 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VAV1P15498 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VAV1P15498 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VAV1P15498 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VAV1P15498 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VAV1P15498 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms