Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRAFP15056 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRAFP15056 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRAFP15056 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRAFP15056 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRAFP15056 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRAFP15056 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRAFP15056 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRAFP15056 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRAFP15056 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRAFP15056 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRAFP15056 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRAFP15056 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRAFP15056 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BRAFP15056 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRAFP15056 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRAFP15056 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRAFP15056 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRAFP15056 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRAFP15056 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRAFP15056 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRAFP15056 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRAFP15056 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRAFP15056 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRAFP15056 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRAFP15056 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRAFP15056 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRAFP15056 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRAFP15056 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BRAFP15056 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BRAFP15056 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BRAFP15056 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BRAFP15056 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRAFP15056 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BRAFP15056 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BRAFP15056 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BRAFP15056 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRAFP15056 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRAFP15056 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRAFP15056 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRAFP15056 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRAFP15056 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRAFP15056 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRAFP15056 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRAFP15056 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRAFP15056 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BRAFP15056 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRAFP15056 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRAFP15056 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRAFP15056 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRAFP15056 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRAFP15056 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRAFP15056 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRAFP15056 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRAFP15056 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRAFP15056 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRAFP15056 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRAFP15056 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRAFP15056 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRAFP15056 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRAFP15056 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRAFP15056 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRAFP15056 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BRAFP15056 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRAFP15056 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRAFP15056 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRAFP15056 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRAFP15056 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BRAFP15056 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRAFP15056 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRAFP15056 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRAFP15056 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRAFP15056 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRAFP15056 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRAFP15056 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRAFP15056 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRAFP15056 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRAFP15056 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRAFP15056 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRAFP15056 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRAFP15056 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRAFP15056 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRAFP15056 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRAFP15056 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRAFP15056 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRAFP15056 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRAFP15056 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRAFP15056 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRAFP15056 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
BRAFP15056 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BRAFP15056 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BRAFP15056 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRAFP15056 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BRAFP15056 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BRAFP15056 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRAFP15056 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BRAFP15056 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
BRAFP15056 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRAFP15056 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BRAFP15056 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms