Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GP1BBP13224 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GP1BBP13224 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GP1BBP13224 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GP1BBP13224 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GP1BBP13224 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GP1BBP13224 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GP1BBP13224 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GP1BBP13224 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GP1BBP13224 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GP1BBP13224 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GP1BBP13224 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GP1BBP13224 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GP1BBP13224 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GP1BBP13224 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GP1BBP13224 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GP1BBP13224 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GP1BBP13224 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GP1BBP13224 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GP1BBP13224 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GP1BBP13224 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GP1BBP13224 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GP1BBP13224 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GP1BBP13224 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GP1BBP13224 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GP1BBP13224 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GP1BBP13224 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GP1BBP13224 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GP1BBP13224 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GP1BBP13224 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GP1BBP13224 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GP1BBP13224 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GP1BBP13224 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GP1BBP13224 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GP1BBP13224 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GP1BBP13224 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GP1BBP13224 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GP1BBP13224 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GP1BBP13224 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GP1BBP13224 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GP1BBP13224 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GP1BBP13224 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GP1BBP13224 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GP1BBP13224 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GP1BBP13224 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GP1BBP13224 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GP1BBP13224 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GP1BBP13224 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GP1BBP13224 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GP1BBP13224 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GP1BBP13224 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GP1BBP13224 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GP1BBP13224 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GP1BBP13224 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GP1BBP13224 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GP1BBP13224 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GP1BBP13224 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GP1BBP13224 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GP1BBP13224 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GP1BBP13224 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GP1BBP13224 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GP1BBP13224 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GP1BBP13224 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GP1BBP13224 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GP1BBP13224 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GP1BBP13224 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GP1BBP13224 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GP1BBP13224 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GP1BBP13224 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GP1BBP13224 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GP1BBP13224 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GP1BBP13224 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GP1BBP13224 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GP1BBP13224 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GP1BBP13224 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GP1BBP13224 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GP1BBP13224 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GP1BBP13224 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms