Protein–RNA interactions for Protein: P12235

SLC25A4, ADP/ATP translocase 1, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A4P12235 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A4P12235 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A4P12235 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A4P12235 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A4P12235 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A4P12235 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A4P12235 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC25A4P12235 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A4P12235 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A4P12235 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A4P12235 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A4P12235 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A4P12235 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A4P12235 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A4P12235 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A4P12235 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC25A4P12235 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A4P12235 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC25A4P12235 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC25A4P12235 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC25A4P12235 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A4P12235 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC25A4P12235 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A4P12235 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A4P12235 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC25A4P12235 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC25A4P12235 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC25A4P12235 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A4P12235 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC25A4P12235 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC25A4P12235 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A4P12235 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A4P12235 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC25A4P12235 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A4P12235 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC25A4P12235 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC25A4P12235 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A4P12235 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A4P12235 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A4P12235 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC25A4P12235 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A4P12235 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A4P12235 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC25A4P12235 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC25A4P12235 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A4P12235 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A4P12235 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC25A4P12235 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A4P12235 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A4P12235 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC25A4P12235 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC25A4P12235 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A4P12235 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A4P12235 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC25A4P12235 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC25A4P12235 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A4P12235 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC25A4P12235 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A4P12235 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A4P12235 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC25A4P12235 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A4P12235 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A4P12235 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC25A4P12235 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A4P12235 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC25A4P12235 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC25A4P12235 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A4P12235 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC25A4P12235 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A4P12235 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A4P12235 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC25A4P12235 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A4P12235 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC25A4P12235 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC25A4P12235 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC25A4P12235 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A4P12235 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A4P12235 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC25A4P12235 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A4P12235 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC25A4P12235 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A4P12235 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A4P12235 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A4P12235 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC25A4P12235 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC25A4P12235 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC25A4P12235 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC25A4P12235 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A4P12235 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A4P12235 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A4P12235 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A4P12235 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A4P12235 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A4P12235 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A4P12235 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A4P12235 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms