Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI4P10075 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GLI4P10075 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI4P10075 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GLI4P10075 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI4P10075 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GLI4P10075 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI4P10075 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI4P10075 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI4P10075 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI4P10075 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GLI4P10075 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GLI4P10075 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI4P10075 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GLI4P10075 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI4P10075 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GLI4P10075 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI4P10075 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GLI4P10075 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GLI4P10075 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI4P10075 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI4P10075 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI4P10075 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI4P10075 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GLI4P10075 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GLI4P10075 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI4P10075 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GLI4P10075 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GLI4P10075 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI4P10075 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GLI4P10075 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI4P10075 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GLI4P10075 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI4P10075 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GLI4P10075 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI4P10075 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GLI4P10075 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GLI4P10075 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI4P10075 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GLI4P10075 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GLI4P10075 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GLI4P10075 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI4P10075 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI4P10075 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI4P10075 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI4P10075 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI4P10075 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI4P10075 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI4P10075 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI4P10075 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI4P10075 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI4P10075 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI4P10075 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI4P10075 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLI4P10075 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GLI4P10075 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GLI4P10075 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI4P10075 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI4P10075 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI4P10075 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GLI4P10075 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GLI4P10075 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI4P10075 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GLI4P10075 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GLI4P10075 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GLI4P10075 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GLI4P10075 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI4P10075 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GLI4P10075 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GLI4P10075 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI4P10075 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI4P10075 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GLI4P10075 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI4P10075 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLI4P10075 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI4P10075 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLI4P10075 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLI4P10075 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI4P10075 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLI4P10075 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLI4P10075 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI4P10075 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLI4P10075 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI4P10075 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLI4P10075 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI4P10075 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI4P10075 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI4P10075 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI4P10075 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLI4P10075 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GLI4P10075 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GLI4P10075 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI4P10075 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GLI4P10075 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GLI4P10075 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI4P10075 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI4P10075 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI4P10075 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GLI4P10075 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI4P10075 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms