Protein–RNA interactions for Protein: P0DP72

VSIG10L2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10L2P0DP72 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG10L2P0DP72 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG10L2P0DP72 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSIG10L2P0DP72 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG10L2P0DP72 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSIG10L2P0DP72 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSIG10L2P0DP72 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSIG10L2P0DP72 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSIG10L2P0DP72 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10L2P0DP72 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10L2P0DP72 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms