Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMIGD3P0DMS9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMIGD3P0DMS9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMIGD3P0DMS9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMIGD3P0DMS9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMIGD3P0DMS9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMIGD3P0DMS9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMIGD3P0DMS9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMIGD3P0DMS9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMIGD3P0DMS9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMIGD3P0DMS9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIGD3P0DMS9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMIGD3P0DMS9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMIGD3P0DMS9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMIGD3P0DMS9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMIGD3P0DMS9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMIGD3P0DMS9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMIGD3P0DMS9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMIGD3P0DMS9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMIGD3P0DMS9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMIGD3P0DMS9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMIGD3P0DMS9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMIGD3P0DMS9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMIGD3P0DMS9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMIGD3P0DMS9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMIGD3P0DMS9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMIGD3P0DMS9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMIGD3P0DMS9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMIGD3P0DMS9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMIGD3P0DMS9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMIGD3P0DMS9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMIGD3P0DMS9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMIGD3P0DMS9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMIGD3P0DMS9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMIGD3P0DMS9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMIGD3P0DMS9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMIGD3P0DMS9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMIGD3P0DMS9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMIGD3P0DMS9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMIGD3P0DMS9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMIGD3P0DMS9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMIGD3P0DMS9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMIGD3P0DMS9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMIGD3P0DMS9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMIGD3P0DMS9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMIGD3P0DMS9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMIGD3P0DMS9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMIGD3P0DMS9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMIGD3P0DMS9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMIGD3P0DMS9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMIGD3P0DMS9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMIGD3P0DMS9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMIGD3P0DMS9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMIGD3P0DMS9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMIGD3P0DMS9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMIGD3P0DMS9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMIGD3P0DMS9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TMIGD3P0DMS9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TMIGD3P0DMS9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMIGD3P0DMS9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMIGD3P0DMS9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMIGD3P0DMS9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMIGD3P0DMS9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMIGD3P0DMS9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMIGD3P0DMS9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMIGD3P0DMS9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMIGD3P0DMS9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMIGD3P0DMS9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMIGD3P0DMS9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMIGD3P0DMS9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMIGD3P0DMS9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMIGD3P0DMS9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD3P0DMS9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMIGD3P0DMS9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMIGD3P0DMS9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMIGD3P0DMS9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMIGD3P0DMS9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMIGD3P0DMS9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMIGD3P0DMS9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMIGD3P0DMS9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMIGD3P0DMS9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMIGD3P0DMS9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMIGD3P0DMS9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMIGD3P0DMS9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMIGD3P0DMS9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms