Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX0

ZNF728, Zinc finger protein 728, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF728P0DKX0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF728P0DKX0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF728P0DKX0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF728P0DKX0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF728P0DKX0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF728P0DKX0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF728P0DKX0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF728P0DKX0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF728P0DKX0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF728P0DKX0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF728P0DKX0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF728P0DKX0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF728P0DKX0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF728P0DKX0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF728P0DKX0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF728P0DKX0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF728P0DKX0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF728P0DKX0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF728P0DKX0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF728P0DKX0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF728P0DKX0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF728P0DKX0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF728P0DKX0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF728P0DKX0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF728P0DKX0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF728P0DKX0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF728P0DKX0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF728P0DKX0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF728P0DKX0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF728P0DKX0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF728P0DKX0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF728P0DKX0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF728P0DKX0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF728P0DKX0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF728P0DKX0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF728P0DKX0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF728P0DKX0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF728P0DKX0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF728P0DKX0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF728P0DKX0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF728P0DKX0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF728P0DKX0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZNF728P0DKX0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZNF728P0DKX0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF728P0DKX0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF728P0DKX0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZNF728P0DKX0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF728P0DKX0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF728P0DKX0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF728P0DKX0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF728P0DKX0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF728P0DKX0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF728P0DKX0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF728P0DKX0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF728P0DKX0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF728P0DKX0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF728P0DKX0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF728P0DKX0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF728P0DKX0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF728P0DKX0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF728P0DKX0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF728P0DKX0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF728P0DKX0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF728P0DKX0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF728P0DKX0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF728P0DKX0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF728P0DKX0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF728P0DKX0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF728P0DKX0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF728P0DKX0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF728P0DKX0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF728P0DKX0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF728P0DKX0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms