Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NMBP08949 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NMBP08949 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NMBP08949 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NMBP08949 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NMBP08949 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NMBP08949 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NMBP08949 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NMBP08949 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NMBP08949 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NMBP08949 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NMBP08949 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NMBP08949 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NMBP08949 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NMBP08949 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NMBP08949 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NMBP08949 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NMBP08949 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NMBP08949 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NMBP08949 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NMBP08949 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NMBP08949 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMBP08949 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NMBP08949 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMBP08949 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NMBP08949 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBP08949 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBP08949 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBP08949 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NMBP08949 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NMBP08949 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMBP08949 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NMBP08949 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBP08949 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBP08949 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NMBP08949 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NMBP08949 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NMBP08949 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NMBP08949 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMBP08949 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMBP08949 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NMBP08949 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMBP08949 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NMBP08949 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBP08949 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBP08949 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NMBP08949 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMBP08949 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMBP08949 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMBP08949 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NMBP08949 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBP08949 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBP08949 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBP08949 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBP08949 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBP08949 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NMBP08949 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NMBP08949 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NMBP08949 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMBP08949 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NMBP08949 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NMBP08949 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NMBP08949 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBP08949 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBP08949 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NMBP08949 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMBP08949 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMBP08949 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMBP08949 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NMBP08949 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBP08949 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBP08949 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NMBP08949 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NMBP08949 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMBP08949 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NMBP08949 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBP08949 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBP08949 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NMBP08949 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NMBP08949 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMBP08949 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NMBP08949 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NMBP08949 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NMBP08949 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBP08949 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBP08949 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NMBP08949 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBP08949 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBP08949 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NMBP08949 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMBP08949 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMBP08949 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMBP08949 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NMBP08949 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMBP08949 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NMBP08949 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBP08949 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NMBP08949 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMBP08949 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NMBP08949 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms