Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PTPRCP08575 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PTPRCP08575 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PTPRCP08575 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTPRCP08575 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRCP08575 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTPRCP08575 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRCP08575 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRCP08575 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRCP08575 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRCP08575 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
PTPRCP08575 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PTPRCP08575 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTPRCP08575 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRCP08575 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PTPRCP08575 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PTPRCP08575 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
PTPRCP08575 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRCP08575 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
PTPRCP08575 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRCP08575 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTPRCP08575 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTPRCP08575 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRCP08575 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRCP08575 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRCP08575 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRCP08575 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRCP08575 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRCP08575 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRCP08575 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRCP08575 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRCP08575 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRCP08575 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRCP08575 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRCP08575 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PTPRCP08575 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRCP08575 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRCP08575 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRCP08575 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRCP08575 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRCP08575 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRCP08575 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRCP08575 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PTPRCP08575 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
PTPRCP08575 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRCP08575 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PTPRCP08575 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PTPRCP08575 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRCP08575 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PTPRCP08575 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PTPRCP08575 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRCP08575 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRCP08575 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PTPRCP08575 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRCP08575 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PTPRCP08575 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PTPRCP08575 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PTPRCP08575 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTPRCP08575 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRCP08575 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRCP08575 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PTPRCP08575 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PTPRCP08575 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRCP08575 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRCP08575 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PTPRCP08575 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRCP08575 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PTPRCP08575 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRCP08575 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRCP08575 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRCP08575 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRCP08575 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRCP08575 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRCP08575 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRCP08575 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRCP08575 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRCP08575 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRCP08575 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRCP08575 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRCP08575 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRCP08575 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRCP08575 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRCP08575 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRCP08575 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRCP08575 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRCP08575 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRCP08575 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRCP08575 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRCP08575 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRCP08575 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRCP08575 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRCP08575 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRCP08575 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRCP08575 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRCP08575 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRCP08575 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRCP08575 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRCP08575 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRCP08575 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRCP08575 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
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