Protein–RNA interactions for Protein: P07320

CRYGD, Gamma-crystallin D, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYGDP07320 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRYGDP07320 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRYGDP07320 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRYGDP07320 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRYGDP07320 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRYGDP07320 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRYGDP07320 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRYGDP07320 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRYGDP07320 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CRYGDP07320 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRYGDP07320 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CRYGDP07320 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRYGDP07320 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CRYGDP07320 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CRYGDP07320 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRYGDP07320 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CRYGDP07320 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRYGDP07320 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CRYGDP07320 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CRYGDP07320 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRYGDP07320 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRYGDP07320 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CRYGDP07320 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRYGDP07320 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRYGDP07320 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CRYGDP07320 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRYGDP07320 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRYGDP07320 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CRYGDP07320 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CRYGDP07320 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CRYGDP07320 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRYGDP07320 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRYGDP07320 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CRYGDP07320 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CRYGDP07320 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRYGDP07320 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRYGDP07320 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRYGDP07320 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CRYGDP07320 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CRYGDP07320 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CRYGDP07320 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CRYGDP07320 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CRYGDP07320 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CRYGDP07320 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CRYGDP07320 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CRYGDP07320 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CRYGDP07320 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CRYGDP07320 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CRYGDP07320 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CRYGDP07320 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CRYGDP07320 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CRYGDP07320 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CRYGDP07320 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CRYGDP07320 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CRYGDP07320 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
CRYGDP07320 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CRYGDP07320 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CRYGDP07320 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms