Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGB2P05107 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGB2P05107 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGB2P05107 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB2P05107 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGB2P05107 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
ITGB2P05107 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGB2P05107 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB2P05107 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB2P05107 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGB2P05107 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB2P05107 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB2P05107 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGB2P05107 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGB2P05107 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGB2P05107 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB2P05107 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ITGB2P05107 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ITGB2P05107 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ITGB2P05107 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB2P05107 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB2P05107 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB2P05107 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB2P05107 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB2P05107 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB2P05107 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB2P05107 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB2P05107 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB2P05107 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB2P05107 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB2P05107 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ITGB2P05107 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ITGB2P05107 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB2P05107 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB2P05107 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB2P05107 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB2P05107 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB2P05107 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB2P05107 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ITGB2P05107 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB2P05107 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB2P05107 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB2P05107 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB2P05107 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB2P05107 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB2P05107 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB2P05107 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB2P05107 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB2P05107 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB2P05107 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB2P05107 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB2P05107 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB2P05107 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB2P05107 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB2P05107 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB2P05107 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB2P05107 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB2P05107 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB2P05107 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB2P05107 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB2P05107 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB2P05107 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB2P05107 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB2P05107 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB2P05107 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ITGB2P05107 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ITGB2P05107 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ITGB2P05107 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB2P05107 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ITGB2P05107 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ITGB2P05107 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB2P05107 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB2P05107 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB2P05107 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB2P05107 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ITGB2P05107 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB2P05107 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ITGB2P05107 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB2P05107 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ITGB2P05107 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB2P05107 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ITGB2P05107 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB2P05107 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITGB2P05107 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB2P05107 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITGB2P05107 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB2P05107 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB2P05107 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITGB2P05107 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITGB2P05107 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB2P05107 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITGB2P05107 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB2P05107 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB2P05107 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITGB2P05107 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITGB2P05107 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGB2P05107 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITGB2P05107 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB2P05107 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGB2P05107 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms