Protein–RNA interactions for Protein: P01861

IGHG4, Immunoglobulin heavy constant gamma 4, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG4P01861 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHG4P01861 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHG4P01861 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGHG4P01861 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHG4P01861 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHG4P01861 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHG4P01861 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHG4P01861 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGHG4P01861 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHG4P01861 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHG4P01861 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IGHG4P01861 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGHG4P01861 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IGHG4P01861 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IGHG4P01861 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IGHG4P01861 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG4P01861 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG4P01861 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG4P01861 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IGHG4P01861 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IGHG4P01861 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHG4P01861 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHG4P01861 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHG4P01861 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IGHG4P01861 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IGHG4P01861 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IGHG4P01861 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IGHG4P01861 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IGHG4P01861 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGHG4P01861 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGHG4P01861 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHG4P01861 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHG4P01861 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGHG4P01861 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHG4P01861 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IGHG4P01861 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHG4P01861 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHG4P01861 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGHG4P01861 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms