Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LCA5LO95447 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LCA5LO95447 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LCA5LO95447 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LCA5LO95447 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LCA5LO95447 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LCA5LO95447 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LCA5LO95447 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LCA5LO95447 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LCA5LO95447 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LCA5LO95447 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LCA5LO95447 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LCA5LO95447 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LCA5LO95447 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LCA5LO95447 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LCA5LO95447 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LCA5LO95447 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LCA5LO95447 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LCA5LO95447 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LCA5LO95447 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LCA5LO95447 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LCA5LO95447 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LCA5LO95447 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LCA5LO95447 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LCA5LO95447 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LCA5LO95447 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
LCA5LO95447 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LCA5LO95447 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LCA5LO95447 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LCA5LO95447 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LCA5LO95447 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LCA5LO95447 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LCA5LO95447 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LCA5LO95447 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LCA5LO95447 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LCA5LO95447 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LCA5LO95447 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LCA5LO95447 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LCA5LO95447 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LCA5LO95447 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LCA5LO95447 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LCA5LO95447 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
LCA5LO95447 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LCA5LO95447 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LCA5LO95447 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LCA5LO95447 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LCA5LO95447 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LCA5LO95447 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LCA5LO95447 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LCA5LO95447 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LCA5LO95447 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LCA5LO95447 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LCA5LO95447 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LCA5LO95447 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LCA5LO95447 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LCA5LO95447 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LCA5LO95447 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LCA5LO95447 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LCA5LO95447 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LCA5LO95447 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LCA5LO95447 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LCA5LO95447 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LCA5LO95447 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LCA5LO95447 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LCA5LO95447 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LCA5LO95447 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LCA5LO95447 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LCA5LO95447 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LCA5LO95447 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LCA5LO95447 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LCA5LO95447 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LCA5LO95447 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LCA5LO95447 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LCA5LO95447 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LCA5LO95447 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LCA5LO95447 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LCA5LO95447 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LCA5LO95447 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LCA5LO95447 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LCA5LO95447 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LCA5LO95447 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LCA5LO95447 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LCA5LO95447 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LCA5LO95447 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LCA5LO95447 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LCA5LO95447 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LCA5LO95447 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LCA5LO95447 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LCA5LO95447 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LCA5LO95447 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LCA5LO95447 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LCA5LO95447 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LCA5LO95447 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LCA5LO95447 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LCA5LO95447 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LCA5LO95447 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
LCA5LO95447 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LCA5LO95447 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LCA5LO95447 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LCA5LO95447 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms