Protein–RNA interactions for Protein: O95361

TRIM16, Tripartite motif-containing protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16O95361 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM16O95361 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM16O95361 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM16O95361 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM16O95361 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM16O95361 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRIM16O95361 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM16O95361 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM16O95361 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM16O95361 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM16O95361 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM16O95361 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM16O95361 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM16O95361 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM16O95361 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRIM16O95361 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TRIM16O95361 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM16O95361 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM16O95361 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM16O95361 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM16O95361 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM16O95361 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM16O95361 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM16O95361 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM16O95361 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM16O95361 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM16O95361 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM16O95361 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM16O95361 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM16O95361 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM16O95361 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM16O95361 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM16O95361 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM16O95361 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TRIM16O95361 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM16O95361 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM16O95361 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRIM16O95361 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM16O95361 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM16O95361 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM16O95361 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM16O95361 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM16O95361 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM16O95361 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM16O95361 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM16O95361 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM16O95361 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM16O95361 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM16O95361 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM16O95361 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM16O95361 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM16O95361 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TRIM16O95361 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM16O95361 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM16O95361 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM16O95361 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM16O95361 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM16O95361 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM16O95361 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM16O95361 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRIM16O95361 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM16O95361 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRIM16O95361 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRIM16O95361 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM16O95361 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRIM16O95361 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRIM16O95361 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM16O95361 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM16O95361 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM16O95361 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM16O95361 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM16O95361 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms