Protein–RNA interactions for Protein: O95259

KCNH1, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 1, humanhuman

Predictions only

Length 989 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH1O95259 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNH1O95259 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH1O95259 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH1O95259 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNH1O95259 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNH1O95259 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH1O95259 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNH1O95259 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNH1O95259 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH1O95259 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH1O95259 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KCNH1O95259 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH1O95259 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH1O95259 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH1O95259 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH1O95259 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH1O95259 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH1O95259 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH1O95259 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH1O95259 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH1O95259 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH1O95259 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH1O95259 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH1O95259 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH1O95259 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNH1O95259 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNH1O95259 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNH1O95259 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNH1O95259 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNH1O95259 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNH1O95259 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNH1O95259 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH1O95259 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNH1O95259 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH1O95259 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH1O95259 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNH1O95259 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH1O95259 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH1O95259 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNH1O95259 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNH1O95259 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH1O95259 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH1O95259 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNH1O95259 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH1O95259 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNH1O95259 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNH1O95259 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH1O95259 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNH1O95259 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNH1O95259 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNH1O95259 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCNH1O95259 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNH1O95259 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH1O95259 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNH1O95259 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH1O95259 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNH1O95259 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH1O95259 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNH1O95259 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH1O95259 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNH1O95259 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH1O95259 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH1O95259 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH1O95259 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH1O95259 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH1O95259 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNH1O95259 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNH1O95259 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH1O95259 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH1O95259 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH1O95259 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms