Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKD3O94806 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKD3O94806 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKD3O94806 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKD3O94806 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKD3O94806 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKD3O94806 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKD3O94806 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKD3O94806 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKD3O94806 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKD3O94806 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKD3O94806 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRKD3O94806 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKD3O94806 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRKD3O94806 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKD3O94806 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRKD3O94806 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKD3O94806 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRKD3O94806 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKD3O94806 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKD3O94806 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRKD3O94806 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRKD3O94806 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRKD3O94806 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRKD3O94806 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKD3O94806 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKD3O94806 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKD3O94806 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRKD3O94806 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKD3O94806 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRKD3O94806 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRKD3O94806 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRKD3O94806 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKD3O94806 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKD3O94806 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKD3O94806 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKD3O94806 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKD3O94806 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKD3O94806 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRKD3O94806 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRKD3O94806 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKD3O94806 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKD3O94806 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKD3O94806 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKD3O94806 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKD3O94806 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKD3O94806 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKD3O94806 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKD3O94806 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKD3O94806 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKD3O94806 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKD3O94806 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRKD3O94806 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKD3O94806 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKD3O94806 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKD3O94806 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKD3O94806 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKD3O94806 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKD3O94806 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKD3O94806 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKD3O94806 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKD3O94806 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRKD3O94806 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKD3O94806 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKD3O94806 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKD3O94806 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKD3O94806 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKD3O94806 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKD3O94806 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKD3O94806 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKD3O94806 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKD3O94806 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKD3O94806 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRKD3O94806 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKD3O94806 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKD3O94806 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRKD3O94806 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKD3O94806 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms