Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALDH1A2O94788 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALDH1A2O94788 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALDH1A2O94788 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALDH1A2O94788 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALDH1A2O94788 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ALDH1A2O94788 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALDH1A2O94788 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALDH1A2O94788 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ALDH1A2O94788 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALDH1A2O94788 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ALDH1A2O94788 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALDH1A2O94788 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ALDH1A2O94788 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALDH1A2O94788 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ALDH1A2O94788 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ALDH1A2O94788 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALDH1A2O94788 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ALDH1A2O94788 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ALDH1A2O94788 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALDH1A2O94788 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ALDH1A2O94788 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALDH1A2O94788 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALDH1A2O94788 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ALDH1A2O94788 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALDH1A2O94788 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ALDH1A2O94788 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ALDH1A2O94788 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALDH1A2O94788 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ALDH1A2O94788 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ALDH1A2O94788 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALDH1A2O94788 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ALDH1A2O94788 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALDH1A2O94788 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ALDH1A2O94788 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ALDH1A2O94788 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ALDH1A2O94788 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ALDH1A2O94788 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ALDH1A2O94788 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALDH1A2O94788 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ALDH1A2O94788 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALDH1A2O94788 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALDH1A2O94788 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALDH1A2O94788 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALDH1A2O94788 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALDH1A2O94788 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALDH1A2O94788 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ALDH1A2O94788 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALDH1A2O94788 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALDH1A2O94788 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALDH1A2O94788 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALDH1A2O94788 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALDH1A2O94788 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALDH1A2O94788 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALDH1A2O94788 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALDH1A2O94788 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALDH1A2O94788 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ALDH1A2O94788 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALDH1A2O94788 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ALDH1A2O94788 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALDH1A2O94788 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ALDH1A2O94788 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ALDH1A2O94788 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALDH1A2O94788 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ALDH1A2O94788 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALDH1A2O94788 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ALDH1A2O94788 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALDH1A2O94788 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALDH1A2O94788 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALDH1A2O94788 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALDH1A2O94788 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALDH1A2O94788 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALDH1A2O94788 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALDH1A2O94788 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ALDH1A2O94788 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ALDH1A2O94788 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALDH1A2O94788 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALDH1A2O94788 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALDH1A2O94788 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ALDH1A2O94788 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALDH1A2O94788 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALDH1A2O94788 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ALDH1A2O94788 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALDH1A2O94788 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ALDH1A2O94788 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ALDH1A2O94788 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALDH1A2O94788 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ALDH1A2O94788 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALDH1A2O94788 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALDH1A2O94788 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALDH1A2O94788 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALDH1A2O94788 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ALDH1A2O94788 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALDH1A2O94788 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALDH1A2O94788 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALDH1A2O94788 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALDH1A2O94788 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ALDH1A2O94788 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALDH1A2O94788 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ALDH1A2O94788 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms