Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCM2O75603 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCM2O75603 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCM2O75603 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCM2O75603 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCM2O75603 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCM2O75603 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCM2O75603 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GCM2O75603 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCM2O75603 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCM2O75603 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCM2O75603 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCM2O75603 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCM2O75603 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCM2O75603 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCM2O75603 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCM2O75603 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCM2O75603 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCM2O75603 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCM2O75603 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCM2O75603 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCM2O75603 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GCM2O75603 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCM2O75603 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCM2O75603 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCM2O75603 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCM2O75603 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCM2O75603 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCM2O75603 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCM2O75603 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCM2O75603 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GCM2O75603 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCM2O75603 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCM2O75603 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GCM2O75603 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GCM2O75603 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GCM2O75603 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GCM2O75603 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCM2O75603 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GCM2O75603 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GCM2O75603 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
GCM2O75603 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GCM2O75603 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCM2O75603 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCM2O75603 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GCM2O75603 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCM2O75603 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCM2O75603 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GCM2O75603 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GCM2O75603 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCM2O75603 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GCM2O75603 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GCM2O75603 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCM2O75603 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GCM2O75603 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCM2O75603 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GCM2O75603 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GCM2O75603 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCM2O75603 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GCM2O75603 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCM2O75603 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GCM2O75603 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCM2O75603 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GCM2O75603 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCM2O75603 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GCM2O75603 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GCM2O75603 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GCM2O75603 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCM2O75603 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCM2O75603 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCM2O75603 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCM2O75603 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCM2O75603 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCM2O75603 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCM2O75603 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCM2O75603 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCM2O75603 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCM2O75603 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCM2O75603 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCM2O75603 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCM2O75603 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GCM2O75603 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCM2O75603 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCM2O75603 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCM2O75603 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCM2O75603 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCM2O75603 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCM2O75603 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCM2O75603 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GCM2O75603 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCM2O75603 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCM2O75603 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCM2O75603 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCM2O75603 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GCM2O75603 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCM2O75603 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCM2O75603 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GCM2O75603 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCM2O75603 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GCM2O75603 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms