Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRCPO75575 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRCPO75575 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CRCPO75575 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CRCPO75575 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CRCPO75575 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CRCPO75575 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CRCPO75575 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CRCPO75575 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRCPO75575 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CRCPO75575 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CRCPO75575 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRCPO75575 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CRCPO75575 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CRCPO75575 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CRCPO75575 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRCPO75575 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CRCPO75575 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRCPO75575 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRCPO75575 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRCPO75575 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CRCPO75575 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRCPO75575 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRCPO75575 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CRCPO75575 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRCPO75575 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CRCPO75575 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CRCPO75575 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRCPO75575 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRCPO75575 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CRCPO75575 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRCPO75575 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRCPO75575 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CRCPO75575 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRCPO75575 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRCPO75575 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CRCPO75575 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CRCPO75575 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CRCPO75575 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRCPO75575 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRCPO75575 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRCPO75575 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRCPO75575 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRCPO75575 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRCPO75575 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRCPO75575 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRCPO75575 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRCPO75575 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRCPO75575 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRCPO75575 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRCPO75575 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRCPO75575 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRCPO75575 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CRCPO75575 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRCPO75575 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRCPO75575 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRCPO75575 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRCPO75575 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CRCPO75575 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CRCPO75575 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRCPO75575 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRCPO75575 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRCPO75575 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRCPO75575 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRCPO75575 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRCPO75575 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRCPO75575 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRCPO75575 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRCPO75575 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRCPO75575 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRCPO75575 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRCPO75575 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRCPO75575 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRCPO75575 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRCPO75575 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CRCPO75575 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CRCPO75575 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRCPO75575 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRCPO75575 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRCPO75575 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRCPO75575 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRCPO75575 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRCPO75575 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRCPO75575 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CRCPO75575 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CRCPO75575 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CRCPO75575 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CRCPO75575 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRCPO75575 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRCPO75575 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRCPO75575 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CRCPO75575 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRCPO75575 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRCPO75575 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRCPO75575 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRCPO75575 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRCPO75575 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRCPO75575 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRCPO75575 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRCPO75575 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms