Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF254O75437 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF254O75437 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF254O75437 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF254O75437 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF254O75437 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF254O75437 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF254O75437 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF254O75437 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF254O75437 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF254O75437 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF254O75437 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF254O75437 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF254O75437 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF254O75437 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF254O75437 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF254O75437 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF254O75437 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF254O75437 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF254O75437 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF254O75437 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF254O75437 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF254O75437 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF254O75437 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF254O75437 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF254O75437 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF254O75437 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF254O75437 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF254O75437 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF254O75437 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF254O75437 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF254O75437 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF254O75437 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF254O75437 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF254O75437 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF254O75437 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF254O75437 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF254O75437 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF254O75437 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF254O75437 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF254O75437 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF254O75437 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF254O75437 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF254O75437 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF254O75437 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF254O75437 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF254O75437 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF254O75437 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF254O75437 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF254O75437 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF254O75437 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF254O75437 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF254O75437 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF254O75437 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF254O75437 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF254O75437 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF254O75437 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF254O75437 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF254O75437 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF254O75437 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF254O75437 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF254O75437 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF254O75437 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF254O75437 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF254O75437 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF254O75437 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF254O75437 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF254O75437 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF254O75437 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF254O75437 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF254O75437 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF254O75437 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF254O75437 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF254O75437 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF254O75437 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF254O75437 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF254O75437 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZNF254O75437 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF254O75437 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF254O75437 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF254O75437 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF254O75437 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF254O75437 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms