Protein–RNA interactions for Protein: O75334

PPFIA2, Liprin-alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA2O75334 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPFIA2O75334 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPFIA2O75334 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA2O75334 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPFIA2O75334 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPFIA2O75334 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPFIA2O75334 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPFIA2O75334 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPFIA2O75334 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA2O75334 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PPFIA2O75334 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PPFIA2O75334 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
PPFIA2O75334 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PPFIA2O75334 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PPFIA2O75334 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIA2O75334 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIA2O75334 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PPFIA2O75334 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PPFIA2O75334 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PPFIA2O75334 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PPFIA2O75334 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PPFIA2O75334 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA2O75334 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA2O75334 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPFIA2O75334 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPFIA2O75334 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPFIA2O75334 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPFIA2O75334 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPFIA2O75334 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PPFIA2O75334 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA2O75334 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA2O75334 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPFIA2O75334 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA2O75334 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPFIA2O75334 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA2O75334 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPFIA2O75334 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPFIA2O75334 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PPFIA2O75334 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA2O75334 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA2O75334 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA2O75334 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPFIA2O75334 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPFIA2O75334 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPFIA2O75334 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPFIA2O75334 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIA2O75334 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPFIA2O75334 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA2O75334 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPFIA2O75334 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPFIA2O75334 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PPFIA2O75334 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPFIA2O75334 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPFIA2O75334 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PPFIA2O75334 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPFIA2O75334 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPFIA2O75334 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPFIA2O75334 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA2O75334 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA2O75334 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PPFIA2O75334 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPFIA2O75334 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPFIA2O75334 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPFIA2O75334 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PPFIA2O75334 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PPFIA2O75334 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA2O75334 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PPFIA2O75334 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIA2O75334 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PPFIA2O75334 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIA2O75334 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIA2O75334 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PPFIA2O75334 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA2O75334 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA2O75334 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PPFIA2O75334 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PPFIA2O75334 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PPFIA2O75334 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA2O75334 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA2O75334 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIA2O75334 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIA2O75334 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIA2O75334 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA2O75334 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA2O75334 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIA2O75334 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA2O75334 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA2O75334 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIA2O75334 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIA2O75334 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPFIA2O75334 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIA2O75334 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms