Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SIN3BO75182 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SIN3BO75182 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3BO75182 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3BO75182 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3BO75182 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3BO75182 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3BO75182 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3BO75182 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIN3BO75182 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SIN3BO75182 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3BO75182 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SIN3BO75182 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SIN3BO75182 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3BO75182 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3BO75182 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3BO75182 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3BO75182 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SIN3BO75182 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SIN3BO75182 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SIN3BO75182 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3BO75182 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SIN3BO75182 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3BO75182 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SIN3BO75182 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SIN3BO75182 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3BO75182 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3BO75182 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SIN3BO75182 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SIN3BO75182 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SIN3BO75182 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SIN3BO75182 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SIN3BO75182 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3BO75182 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3BO75182 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SIN3BO75182 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3BO75182 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SIN3BO75182 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3BO75182 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3BO75182 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SIN3BO75182 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3BO75182 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SIN3BO75182 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3BO75182 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3BO75182 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SIN3BO75182 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3BO75182 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3BO75182 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SIN3BO75182 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3BO75182 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3BO75182 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SIN3BO75182 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SIN3BO75182 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SIN3BO75182 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SIN3BO75182 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3BO75182 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3BO75182 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SIN3BO75182 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3BO75182 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SIN3BO75182 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SIN3BO75182 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SIN3BO75182 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SIN3BO75182 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3BO75182 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3BO75182 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3BO75182 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3BO75182 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3BO75182 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3BO75182 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3BO75182 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3BO75182 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3BO75182 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3BO75182 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3BO75182 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3BO75182 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3BO75182 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3BO75182 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3BO75182 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SIN3BO75182 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SIN3BO75182 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SIN3BO75182 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3BO75182 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SIN3BO75182 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SIN3BO75182 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3BO75182 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3BO75182 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3BO75182 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3BO75182 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SIN3BO75182 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3BO75182 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SIN3BO75182 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SIN3BO75182 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SIN3BO75182 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3BO75182 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SIN3BO75182 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3BO75182 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3BO75182 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3BO75182 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SIN3BO75182 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SIN3BO75182 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms