Protein–RNA interactions for Protein: O60522

TDRD6, Tudor domain-containing protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD6O60522 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TDRD6O60522 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TDRD6O60522 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TDRD6O60522 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TDRD6O60522 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD6O60522 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TDRD6O60522 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TDRD6O60522 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD6O60522 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TDRD6O60522 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TDRD6O60522 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD6O60522 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TDRD6O60522 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD6O60522 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD6O60522 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TDRD6O60522 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TDRD6O60522 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TDRD6O60522 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD6O60522 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD6O60522 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD6O60522 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD6O60522 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TDRD6O60522 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TDRD6O60522 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
TDRD6O60522 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TDRD6O60522 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TDRD6O60522 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TDRD6O60522 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD6O60522 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD6O60522 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TDRD6O60522 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD6O60522 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD6O60522 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TDRD6O60522 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TDRD6O60522 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TDRD6O60522 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TDRD6O60522 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TDRD6O60522 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TDRD6O60522 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TDRD6O60522 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TDRD6O60522 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TDRD6O60522 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TDRD6O60522 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDRD6O60522 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TDRD6O60522 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TDRD6O60522 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TDRD6O60522 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TDRD6O60522 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TDRD6O60522 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TDRD6O60522 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TDRD6O60522 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDRD6O60522 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDRD6O60522 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TDRD6O60522 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDRD6O60522 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TDRD6O60522 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TDRD6O60522 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDRD6O60522 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TDRD6O60522 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TDRD6O60522 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TDRD6O60522 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TDRD6O60522 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TDRD6O60522 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TDRD6O60522 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TDRD6O60522 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TDRD6O60522 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TDRD6O60522 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TDRD6O60522 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TDRD6O60522 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TDRD6O60522 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms