Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SH3BP5O60239 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH3BP5O60239 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH3BP5O60239 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH3BP5O60239 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH3BP5O60239 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH3BP5O60239 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH3BP5O60239 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3BP5O60239 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SH3BP5O60239 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SH3BP5O60239 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SH3BP5O60239 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH3BP5O60239 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SH3BP5O60239 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SH3BP5O60239 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH3BP5O60239 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH3BP5O60239 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SH3BP5O60239 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH3BP5O60239 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SH3BP5O60239 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SH3BP5O60239 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
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SH3BP5O60239 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SH3BP5O60239 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SH3BP5O60239 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SH3BP5O60239 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3BP5O60239 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SH3BP5O60239 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3BP5O60239 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SH3BP5O60239 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
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