Protein–RNA interactions for Protein: O60224

SSX4, Protein SSX4, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX4O60224 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSX4O60224 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SSX4O60224 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SSX4O60224 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SSX4O60224 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSX4O60224 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SSX4O60224 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSX4O60224 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSX4O60224 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SSX4O60224 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SSX4O60224 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SSX4O60224 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SSX4O60224 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SSX4O60224 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSX4O60224 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SSX4O60224 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSX4O60224 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSX4O60224 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SSX4O60224 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSX4O60224 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SSX4O60224 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SSX4O60224 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX4O60224 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX4O60224 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SSX4O60224 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX4O60224 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX4O60224 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SSX4O60224 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SSX4O60224 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SSX4O60224 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SSX4O60224 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SSX4O60224 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSX4O60224 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSX4O60224 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSX4O60224 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SSX4O60224 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SSX4O60224 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSX4O60224 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SSX4O60224 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SSX4O60224 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SSX4O60224 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SSX4O60224 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SSX4O60224 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SSX4O60224 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSX4O60224 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SSX4O60224 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SSX4O60224 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSX4O60224 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSX4O60224 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SSX4O60224 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX4O60224 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SSX4O60224 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSX4O60224 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SSX4O60224 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSX4O60224 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSX4O60224 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SSX4O60224 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX4O60224 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX4O60224 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SSX4O60224 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SSX4O60224 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SSX4O60224 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX4O60224 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SSX4O60224 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX4O60224 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SSX4O60224 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSX4O60224 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SSX4O60224 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX4O60224 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX4O60224 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SSX4O60224 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX4O60224 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX4O60224 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SSX4O60224 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX4O60224 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SSX4O60224 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSX4O60224 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSX4O60224 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SSX4O60224 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX4O60224 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SSX4O60224 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SSX4O60224 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SSX4O60224 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSX4O60224 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SSX4O60224 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SSX4O60224 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSX4O60224 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SSX4O60224 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SSX4O60224 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSX4O60224 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSX4O60224 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSX4O60224 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSX4O60224 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSX4O60224 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSX4O60224 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSX4O60224 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSX4O60224 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSX4O60224 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSX4O60224 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SSX4O60224 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms