Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF9O43307 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF9O43307 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF9O43307 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARHGEF9O43307 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARHGEF9O43307 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF9O43307 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARHGEF9O43307 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF9O43307 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARHGEF9O43307 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF9O43307 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARHGEF9O43307 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARHGEF9O43307 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF9O43307 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF9O43307 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF9O43307 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARHGEF9O43307 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF9O43307 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF9O43307 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF9O43307 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF9O43307 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF9O43307 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF9O43307 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF9O43307 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF9O43307 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF9O43307 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF9O43307 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF9O43307 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF9O43307 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF9O43307 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF9O43307 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF9O43307 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF9O43307 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF9O43307 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF9O43307 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF9O43307 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF9O43307 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF9O43307 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF9O43307 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF9O43307 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF9O43307 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF9O43307 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ARHGEF9O43307 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF9O43307 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARHGEF9O43307 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARHGEF9O43307 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARHGEF9O43307 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARHGEF9O43307 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF9O43307 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARHGEF9O43307 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF9O43307 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF9O43307 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARHGEF9O43307 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF9O43307 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ARHGEF9O43307 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ARHGEF9O43307 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ARHGEF9O43307 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF9O43307 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARHGEF9O43307 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF9O43307 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF9O43307 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF9O43307 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARHGEF9O43307 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF9O43307 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF9O43307 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARHGEF9O43307 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARHGEF9O43307 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARHGEF9O43307 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms