Protein–RNA interactions for Protein: O43257

ZNHIT1, Zinc finger HIT domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT1O43257 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNHIT1O43257 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNHIT1O43257 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNHIT1O43257 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNHIT1O43257 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNHIT1O43257 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNHIT1O43257 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNHIT1O43257 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNHIT1O43257 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNHIT1O43257 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNHIT1O43257 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNHIT1O43257 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNHIT1O43257 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNHIT1O43257 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNHIT1O43257 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNHIT1O43257 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNHIT1O43257 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNHIT1O43257 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNHIT1O43257 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNHIT1O43257 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNHIT1O43257 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNHIT1O43257 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNHIT1O43257 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNHIT1O43257 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNHIT1O43257 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNHIT1O43257 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNHIT1O43257 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNHIT1O43257 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNHIT1O43257 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNHIT1O43257 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNHIT1O43257 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNHIT1O43257 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNHIT1O43257 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNHIT1O43257 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNHIT1O43257 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNHIT1O43257 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNHIT1O43257 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNHIT1O43257 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNHIT1O43257 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNHIT1O43257 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNHIT1O43257 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNHIT1O43257 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNHIT1O43257 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNHIT1O43257 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNHIT1O43257 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNHIT1O43257 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNHIT1O43257 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNHIT1O43257 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNHIT1O43257 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNHIT1O43257 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNHIT1O43257 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNHIT1O43257 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNHIT1O43257 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNHIT1O43257 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNHIT1O43257 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNHIT1O43257 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNHIT1O43257 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNHIT1O43257 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNHIT1O43257 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNHIT1O43257 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNHIT1O43257 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNHIT1O43257 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNHIT1O43257 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNHIT1O43257 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNHIT1O43257 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNHIT1O43257 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNHIT1O43257 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNHIT1O43257 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNHIT1O43257 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNHIT1O43257 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNHIT1O43257 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNHIT1O43257 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNHIT1O43257 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNHIT1O43257 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNHIT1O43257 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZNHIT1O43257 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNHIT1O43257 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNHIT1O43257 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNHIT1O43257 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNHIT1O43257 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNHIT1O43257 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNHIT1O43257 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNHIT1O43257 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNHIT1O43257 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNHIT1O43257 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNHIT1O43257 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNHIT1O43257 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms