Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 99.9
RBFOX2O43251 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 99.9
RBFOX2O43251 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 99.9
RBFOX2O43251 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.689e-55■■■■■ 99.8
RBFOX2O43251 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.895e-9■■■■■ 99.6
RBFOX2O43251 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.695e-9■■■■■ 99.6
RBFOX2O43251 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.535e-9■■■■■ 99.6
RBFOX2O43251 NDEL1-217ENST00000583683 1802 ntTSL 214.66□□□□□ -0.065e-9■■■■■ 99.6
RBFOX2O43251 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.695e-9■■■■■ 99.6
RBFOX2O43251 NDEL1-211ENST00000581679 582 ntTSL 43.12□□□□□ -1.915e-9■■■■■ 99.6
RBFOX2O43251 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.492e-28■■■■■ 99.6
RBFOX2O43251 HPD-203ENST00000542159 780 ntTSL 511.06□□□□□ -0.642e-28■■■■■ 99.6
RBFOX2O43251 HPD-201ENST00000289004 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.832e-28■■■■■ 99.6
RBFOX2O43251 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.333e-7■■■■■ 99.4
RBFOX2O43251 C7orf50-204ENST00000412051 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.54■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 99.4
RBFOX2O43251 C7orf50-208ENST00000491163 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.48■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 99.4
RBFOX2O43251 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 99.4
RBFOX2O43251 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.033e-7■■■■■ 99.4
RBFOX2O43251 C7orf50-207ENST00000488073 853 ntTSL 514.08□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 99.4
RBFOX2O43251 C7orf50-205ENST00000444428 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.92□□□□□ -0.53e-7■■■■■ 99.4
RBFOX2O43251 LRP8-209ENST00000480045 3231 ntTSL 516.98■□□□□ 0.317e-7■■■■■ 98.8
RBFOX2O43251 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.187e-7■■■■■ 98.8
RBFOX2O43251 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.187e-7■■■■■ 98.8
RBFOX2O43251 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.297e-7■■■■■ 98.8
RBFOX2O43251 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.47e-7■■■■■ 98.8
RBFOX2O43251 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.547e-7■■■■■ 98.8
RBFOX2O43251 LRP8-208ENST00000475501 721 ntTSL 36.81□□□□□ -1.325e-7■■■■■ 98.8
RBFOX2O43251 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.84□□□□□ -0.514e-9■■■■■ 97.5
RBFOX2O43251 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.984e-9■■■■■ 97.5
RBFOX2O43251 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 96.8
RBFOX2O43251 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 96.2
RBFOX2O43251 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.054e-20■■■■■ 94.9
RBFOX2O43251 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.158e-8■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.178e-8■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.368e-8■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.418e-8■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.468e-8■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.518e-8■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.538e-8■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.558e-8■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.598e-8■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.628e-8■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 TP73-206ENST00000378288 5120 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.758e-8■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 TP73-210ENST00000603364 1551 ntTSL 210.09□□□□□ -0.798e-8■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.891e-17■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 NCAPG2-205ENST00000441982 2926 ntTSL 27.73□□□□□ -1.171e-17■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 57.58□□□□□ -1.21e-17■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 NCAPG2-203ENST00000409423 3957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.211e-17■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)6.7□□□□□ -1.341e-17■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.431e-17■■■■■ 94.6
RBFOX2O43251 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.946e-23■■■■■ 93.4
RBFOX2O43251 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.176e-23■■■■■ 93.4
RBFOX2O43251 ABCA2-207ENST00000437791 697 ntTSL 512.71□□□□□ -0.374e-27■■■■■ 92.9
RBFOX2O43251 CACNA2D4-214ENST00000541616 576 ntTSL 413.2□□□□□ -0.32e-34■■■■■ 92.7
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RBFOX2O43251 NKTR-214ENST00000478488 698 ntTSL 313.79□□□□□ -0.25e-13■■■■■ 91.3
RBFOX2O43251 NKTR-215ENST00000487466 2335 ntTSL 213.28□□□□□ -0.285e-13■■■■■ 91.3
RBFOX2O43251 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.865e-13■■■■■ 91.3
RBFOX2O43251 NKTR-211ENST00000468735 7964 ntTSL 26.24□□□□□ -1.415e-13■■■■■ 91.3
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RBFOX2O43251 NKTR-202ENST00000429888 7325 ntTSL 53.19□□□□□ -1.95e-13■■■■■ 91.3
RBFOX2O43251 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 91.2
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RBFOX2O43251 NOP56-203ENST00000445139 856 ntTSL 510□□□□□ -0.811e-35■■■■■ 91.1
RBFOX2O43251 NOP56-204ENST00000460258 837 ntTSL 48.2□□□□□ -1.11e-35■■■■■ 91.1
RBFOX2O43251 RTEL1-207ENST00000463361 575 ntTSL 410.76□□□□□ -0.697e-10■■■■■ 90.7
RBFOX2O43251 CYFIP1-214ENST00000622576 583 ntTSL 417.21■□□□□ 0.358e-11■■■■■ 89.3
RBFOX2O43251 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.088e-11■■■■■ 89.3
RBFOX2O43251 CYFIP1-205ENST00000612288 553 ntTSL 38.07□□□□□ -1.128e-11■■■■■ 89.3
RBFOX2O43251 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.228e-11■■■■■ 89.3
RBFOX2O43251 RTEL1-202ENST00000356810 1339 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.553e-8■■■■■ 88.4
RBFOX2O43251 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.28■□□□□ 0.23e-11■■■■■ 88.2
RBFOX2O43251 ATP9B-207ENST00000586672 583 ntTSL 411.41□□□□□ -0.583e-11■■■■■ 88.2
RBFOX2O43251 NADSYN1-222ENST00000534634 963 ntTSL 212.26□□□□□ -0.452e-27■■■■■ 87.6
RBFOX2O43251 CDHR2-206ENST00000510636 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.918e-8■■■■■ 87.3
RBFOX2O43251 CDHR2-203ENST00000506348 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.948e-8■■■■■ 87.3
RBFOX2O43251 CDHR2-201ENST00000261944 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.088e-8■■■■■ 87.3
RBFOX2O43251 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.386e-12■■■■■ 86.9
RBFOX2O43251 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.326e-12■■■■■ 86.9
RBFOX2O43251 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.066e-12■■■■■ 86.9
RBFOX2O43251 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.076e-12■■■■■ 86.9
RBFOX2O43251 NUDT16L1-205ENST00000590460 709 ntTSL 314.26□□□□□ -0.136e-12■■■■■ 86.9
RBFOX2O43251 MPRIP-201ENST00000313485 6050 ntTSL 513.8□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 86.1
RBFOX2O43251 MPRIP-215ENST00000579832 438 ntTSL 37.66□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 86.1
RBFOX2O43251 NR1H2-212ENST00000600355 507 ntTSL 311.94□□□□□ -0.56e-8■■■■■ 85.8
RBFOX2O43251 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.722e-7■■■■■ 85.6
RBFOX2O43251 ATP9B-201ENST00000307671 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.916e-11■■■■■ 85.1
RBFOX2O43251 ATP9B-203ENST00000458297 1507 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.946e-11■■■■■ 85.1
RBFOX2O43251 ATP9B-204ENST00000490210 7353 ntTSL 1 (best)8.93□□□□□ -0.986e-11■■■■■ 85.1
RBFOX2O43251 ATP9B-202ENST00000426216 4361 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.186e-11■■■■■ 85.1
RBFOX2O43251 ATP9B-221ENST00000590271 1923 ntTSL 26.06□□□□□ -1.446e-11■■■■■ 85.1
RBFOX2O43251 ATP9B-206ENST00000586366 2845 ntTSL 26.01□□□□□ -1.456e-11■■■■■ 85.1
RBFOX2O43251 PCGF3-209ENST00000475288 604 ntTSL 313.24□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 85.1
RBFOX2O43251 CACNA2D4-217ENST00000545595 1615 ntTSL 1 (best)12.87□□□□□ -0.358e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 CACNA2D4-205ENST00000536846 895 ntTSL 511.76□□□□□ -0.538e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 CACNA2D4-201ENST00000280663 5936 ntTSL 211.65□□□□□ -0.548e-8■■■■■ 84.8
RBFOX2O43251 CACNA2D4-225ENST00000589502 680 ntTSL 311.33□□□□□ -0.68e-8■■■■■ 84.8
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