Protein–RNA interactions for Protein: O15440

ABCC5, Multidrug resistance-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC5O15440 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.4
ABCC5O15440 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
ABCC5O15440 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
ABCC5O15440 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ABCC5O15440 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
ABCC5O15440 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
ABCC5O15440 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
ABCC5O15440 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ABCC5O15440 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
ABCC5O15440 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
ABCC5O15440 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
ABCC5O15440 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ABCC5O15440 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
ABCC5O15440 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
ABCC5O15440 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
ABCC5O15440 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
ABCC5O15440 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
ABCC5O15440 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
ABCC5O15440 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
ABCC5O15440 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
ABCC5O15440 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
ABCC5O15440 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ABCC5O15440 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
ABCC5O15440 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ABCC5O15440 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ABCC5O15440 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
ABCC5O15440 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
ABCC5O15440 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ABCC5O15440 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
ABCC5O15440 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ABCC5O15440 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
ABCC5O15440 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ABCC5O15440 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
ABCC5O15440 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
ABCC5O15440 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
ABCC5O15440 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
ABCC5O15440 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
ABCC5O15440 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
ABCC5O15440 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
ABCC5O15440 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.05■■■■■ 4.32
ABCC5O15440 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
ABCC5O15440 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
ABCC5O15440 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
ABCC5O15440 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
ABCC5O15440 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC5O15440 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
ABCC5O15440 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
ABCC5O15440 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC5O15440 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.93■■■■■ 4.3
ABCC5O15440 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
ABCC5O15440 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
ABCC5O15440 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.9■■■■■ 4.3
ABCC5O15440 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ABCC5O15440 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ABCC5O15440 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ABCC5O15440 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
ABCC5O15440 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ABCC5O15440 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
ABCC5O15440 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
ABCC5O15440 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC5O15440 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC5O15440 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
ABCC5O15440 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
ABCC5O15440 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.74■■■■■ 4.27
ABCC5O15440 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC5O15440 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.72■■■■■ 4.27
ABCC5O15440 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
ABCC5O15440 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
ABCC5O15440 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.69■■■■■ 4.27
ABCC5O15440 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
ABCC5O15440 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
ABCC5O15440 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
ABCC5O15440 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
ABCC5O15440 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ABCC5O15440 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
ABCC5O15440 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ABCC5O15440 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
ABCC5O15440 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
ABCC5O15440 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
ABCC5O15440 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
ABCC5O15440 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
ABCC5O15440 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
ABCC5O15440 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
ABCC5O15440 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ABCC5O15440 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
ABCC5O15440 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
ABCC5O15440 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
ABCC5O15440 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.57■■■■■ 4.25
ABCC5O15440 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
ABCC5O15440 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
ABCC5O15440 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
ABCC5O15440 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
ABCC5O15440 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
ABCC5O15440 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
ABCC5O15440 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.44■■■■■ 4.22
ABCC5O15440 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC5O15440 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
ABCC5O15440 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
ABCC5O15440 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
ABCC5O15440 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms