Protein–RNA interactions for Protein: O15067

PFAS, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFASO15067 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PFASO15067 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PFASO15067 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PFASO15067 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PFASO15067 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PFASO15067 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
PFASO15067 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PFASO15067 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PFASO15067 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PFASO15067 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PFASO15067 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PFASO15067 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PFASO15067 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PFASO15067 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PFASO15067 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PFASO15067 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PFASO15067 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PFASO15067 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PFASO15067 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PFASO15067 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PFASO15067 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PFASO15067 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PFASO15067 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PFASO15067 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PFASO15067 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PFASO15067 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PFASO15067 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
PFASO15067 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PFASO15067 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
PFASO15067 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PFASO15067 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PFASO15067 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PFASO15067 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PFASO15067 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PFASO15067 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PFASO15067 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PFASO15067 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PFASO15067 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PFASO15067 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PFASO15067 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PFASO15067 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PFASO15067 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PFASO15067 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PFASO15067 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PFASO15067 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PFASO15067 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PFASO15067 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PFASO15067 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PFASO15067 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
PFASO15067 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PFASO15067 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PFASO15067 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PFASO15067 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PFASO15067 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PFASO15067 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PFASO15067 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
PFASO15067 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PFASO15067 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PFASO15067 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PFASO15067 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PFASO15067 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PFASO15067 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
PFASO15067 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PFASO15067 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PFASO15067 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PFASO15067 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PFASO15067 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PFASO15067 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PFASO15067 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PFASO15067 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PFASO15067 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PFASO15067 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PFASO15067 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PFASO15067 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PFASO15067 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PFASO15067 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PFASO15067 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PFASO15067 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PFASO15067 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PFASO15067 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PFASO15067 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PFASO15067 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PFASO15067 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PFASO15067 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PFASO15067 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
PFASO15067 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PFASO15067 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PFASO15067 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PFASO15067 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PFASO15067 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PFASO15067 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PFASO15067 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PFASO15067 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PFASO15067 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PFASO15067 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PFASO15067 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PFASO15067 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PFASO15067 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PFASO15067 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PFASO15067 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms