Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOCS6O14544 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SOCS6O14544 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOCS6O14544 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SOCS6O14544 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SOCS6O14544 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SOCS6O14544 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SOCS6O14544 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOCS6O14544 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOCS6O14544 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOCS6O14544 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOCS6O14544 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOCS6O14544 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOCS6O14544 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SOCS6O14544 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SOCS6O14544 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOCS6O14544 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOCS6O14544 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOCS6O14544 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOCS6O14544 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOCS6O14544 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOCS6O14544 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOCS6O14544 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOCS6O14544 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOCS6O14544 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOCS6O14544 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOCS6O14544 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOCS6O14544 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOCS6O14544 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOCS6O14544 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS6O14544 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOCS6O14544 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SOCS6O14544 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOCS6O14544 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOCS6O14544 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOCS6O14544 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SOCS6O14544 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOCS6O14544 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SOCS6O14544 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOCS6O14544 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOCS6O14544 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOCS6O14544 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOCS6O14544 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOCS6O14544 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SOCS6O14544 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOCS6O14544 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOCS6O14544 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOCS6O14544 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOCS6O14544 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOCS6O14544 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SOCS6O14544 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOCS6O14544 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOCS6O14544 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOCS6O14544 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOCS6O14544 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOCS6O14544 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SOCS6O14544 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOCS6O14544 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SOCS6O14544 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOCS6O14544 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOCS6O14544 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOCS6O14544 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SOCS6O14544 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOCS6O14544 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOCS6O14544 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SOCS6O14544 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOCS6O14544 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOCS6O14544 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SOCS6O14544 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOCS6O14544 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SOCS6O14544 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SOCS6O14544 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOCS6O14544 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOCS6O14544 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOCS6O14544 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOCS6O14544 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOCS6O14544 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOCS6O14544 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOCS6O14544 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOCS6O14544 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOCS6O14544 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOCS6O14544 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOCS6O14544 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOCS6O14544 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SOCS6O14544 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOCS6O14544 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms