Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE2AO00408 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE2AO00408 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE2AO00408 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE2AO00408 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE2AO00408 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE2AO00408 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE2AO00408 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE2AO00408 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE2AO00408 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE2AO00408 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE2AO00408 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE2AO00408 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE2AO00408 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE2AO00408 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PDE2AO00408 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE2AO00408 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE2AO00408 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PDE2AO00408 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE2AO00408 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE2AO00408 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE2AO00408 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE2AO00408 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE2AO00408 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PDE2AO00408 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PDE2AO00408 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE2AO00408 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE2AO00408 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PDE2AO00408 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE2AO00408 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PDE2AO00408 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE2AO00408 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE2AO00408 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE2AO00408 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PDE2AO00408 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PDE2AO00408 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE2AO00408 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE2AO00408 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE2AO00408 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE2AO00408 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE2AO00408 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE2AO00408 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE2AO00408 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE2AO00408 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE2AO00408 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE2AO00408 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE2AO00408 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PDE2AO00408 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE2AO00408 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE2AO00408 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE2AO00408 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE2AO00408 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE2AO00408 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE2AO00408 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE2AO00408 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE2AO00408 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE2AO00408 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE2AO00408 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE2AO00408 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE2AO00408 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE2AO00408 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE2AO00408 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE2AO00408 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE2AO00408 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE2AO00408 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE2AO00408 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE2AO00408 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE2AO00408 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE2AO00408 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE2AO00408 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE2AO00408 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE2AO00408 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE2AO00408 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PDE2AO00408 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE2AO00408 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PDE2AO00408 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PDE2AO00408 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE2AO00408 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PDE2AO00408 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE2AO00408 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE2AO00408 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PDE2AO00408 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PDE2AO00408 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE2AO00408 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PDE2AO00408 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE2AO00408 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PDE2AO00408 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PDE2AO00408 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PDE2AO00408 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PDE2AO00408 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE2AO00408 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE2AO00408 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE2AO00408 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PDE2AO00408 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PDE2AO00408 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PDE2AO00408 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE2AO00408 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PDE2AO00408 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE2AO00408 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PDE2AO00408 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms