Protein–RNA interactions for Protein: O00255

MEN1, Menin, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEN1O00255 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEN1O00255 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEN1O00255 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MEN1O00255 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEN1O00255 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEN1O00255 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEN1O00255 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEN1O00255 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEN1O00255 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEN1O00255 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEN1O00255 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MEN1O00255 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MEN1O00255 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
MEN1O00255 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEN1O00255 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEN1O00255 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MEN1O00255 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEN1O00255 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MEN1O00255 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MEN1O00255 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEN1O00255 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEN1O00255 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MEN1O00255 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MEN1O00255 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
MEN1O00255 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
MEN1O00255 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEN1O00255 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MEN1O00255 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MEN1O00255 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MEN1O00255 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEN1O00255 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MEN1O00255 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MEN1O00255 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MEN1O00255 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MEN1O00255 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MEN1O00255 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
MEN1O00255 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEN1O00255 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MEN1O00255 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MEN1O00255 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEN1O00255 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MEN1O00255 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MEN1O00255 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MEN1O00255 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MEN1O00255 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MEN1O00255 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MEN1O00255 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MEN1O00255 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MEN1O00255 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MEN1O00255 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEN1O00255 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MEN1O00255 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MEN1O00255 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MEN1O00255 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MEN1O00255 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MEN1O00255 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEN1O00255 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEN1O00255 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEN1O00255 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEN1O00255 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEN1O00255 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEN1O00255 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEN1O00255 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MEN1O00255 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEN1O00255 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEN1O00255 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MEN1O00255 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MEN1O00255 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEN1O00255 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEN1O00255 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEN1O00255 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEN1O00255 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEN1O00255 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEN1O00255 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEN1O00255 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEN1O00255 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MEN1O00255 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MEN1O00255 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MEN1O00255 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEN1O00255 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MEN1O00255 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEN1O00255 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEN1O00255 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MEN1O00255 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MEN1O00255 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MEN1O00255 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEN1O00255 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEN1O00255 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEN1O00255 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MEN1O00255 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MEN1O00255 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEN1O00255 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEN1O00255 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MEN1O00255 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MEN1O00255 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MEN1O00255 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MEN1O00255 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEN1O00255 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MEN1O00255 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MEN1O00255 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms