Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AP3B1O00203 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AP3B1O00203 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AP3B1O00203 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AP3B1O00203 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AP3B1O00203 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AP3B1O00203 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AP3B1O00203 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AP3B1O00203 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AP3B1O00203 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
AP3B1O00203 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AP3B1O00203 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
AP3B1O00203 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP3B1O00203 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP3B1O00203 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP3B1O00203 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AP3B1O00203 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AP3B1O00203 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP3B1O00203 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP3B1O00203 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
AP3B1O00203 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AP3B1O00203 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AP3B1O00203 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AP3B1O00203 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
AP3B1O00203 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AP3B1O00203 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AP3B1O00203 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AP3B1O00203 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
AP3B1O00203 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
AP3B1O00203 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP3B1O00203 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP3B1O00203 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AP3B1O00203 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AP3B1O00203 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AP3B1O00203 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AP3B1O00203 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AP3B1O00203 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3B1O00203 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3B1O00203 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AP3B1O00203 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP3B1O00203 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP3B1O00203 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP3B1O00203 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AP3B1O00203 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP3B1O00203 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP3B1O00203 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP3B1O00203 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
AP3B1O00203 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP3B1O00203 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP3B1O00203 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP3B1O00203 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP3B1O00203 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP3B1O00203 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AP3B1O00203 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AP3B1O00203 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AP3B1O00203 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3B1O00203 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AP3B1O00203 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
AP3B1O00203 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AP3B1O00203 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
AP3B1O00203 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP3B1O00203 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP3B1O00203 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AP3B1O00203 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AP3B1O00203 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AP3B1O00203 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
AP3B1O00203 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AP3B1O00203 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP3B1O00203 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP3B1O00203 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AP3B1O00203 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP3B1O00203 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP3B1O00203 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms