Protein–RNA interactions for Protein: O00189

AP4M1, AP-4 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4M1O00189 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP4M1O00189 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP4M1O00189 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP4M1O00189 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4M1O00189 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP4M1O00189 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP4M1O00189 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4M1O00189 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4M1O00189 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP4M1O00189 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP4M1O00189 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP4M1O00189 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP4M1O00189 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP4M1O00189 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4M1O00189 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP4M1O00189 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP4M1O00189 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4M1O00189 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4M1O00189 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4M1O00189 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4M1O00189 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP4M1O00189 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4M1O00189 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4M1O00189 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP4M1O00189 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP4M1O00189 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP4M1O00189 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP4M1O00189 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4M1O00189 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4M1O00189 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AP4M1O00189 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4M1O00189 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4M1O00189 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4M1O00189 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AP4M1O00189 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4M1O00189 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AP4M1O00189 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AP4M1O00189 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4M1O00189 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4M1O00189 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AP4M1O00189 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AP4M1O00189 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AP4M1O00189 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4M1O00189 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4M1O00189 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AP4M1O00189 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AP4M1O00189 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AP4M1O00189 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4M1O00189 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AP4M1O00189 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4M1O00189 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AP4M1O00189 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4M1O00189 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4M1O00189 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AP4M1O00189 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4M1O00189 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4M1O00189 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP4M1O00189 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP4M1O00189 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP4M1O00189 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP4M1O00189 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP4M1O00189 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4M1O00189 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4M1O00189 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP4M1O00189 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP4M1O00189 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4M1O00189 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4M1O00189 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4M1O00189 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4M1O00189 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4M1O00189 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4M1O00189 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4M1O00189 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4M1O00189 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4M1O00189 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4M1O00189 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms