Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVH48-1M5A8F1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVH48-1M5A8F1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERVH48-1M5A8F1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERVH48-1M5A8F1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVH48-1M5A8F1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERVH48-1M5A8F1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVH48-1M5A8F1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ERVH48-1M5A8F1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERVH48-1M5A8F1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVH48-1M5A8F1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ERVH48-1M5A8F1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVH48-1M5A8F1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ERVH48-1M5A8F1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ERVH48-1M5A8F1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ERVH48-1M5A8F1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ERVH48-1M5A8F1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVH48-1M5A8F1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ERVH48-1M5A8F1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ERVH48-1M5A8F1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVH48-1M5A8F1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ERVH48-1M5A8F1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVH48-1M5A8F1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ERVH48-1M5A8F1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVH48-1M5A8F1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ERVH48-1M5A8F1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ERVH48-1M5A8F1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVH48-1M5A8F1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ERVH48-1M5A8F1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVH48-1M5A8F1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVH48-1M5A8F1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ERVH48-1M5A8F1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVH48-1M5A8F1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVH48-1M5A8F1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ERVH48-1M5A8F1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ERVH48-1M5A8F1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVH48-1M5A8F1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ERVH48-1M5A8F1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ERVH48-1M5A8F1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVH48-1M5A8F1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVH48-1M5A8F1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ERVH48-1M5A8F1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVH48-1M5A8F1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ERVH48-1M5A8F1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVH48-1M5A8F1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ERVH48-1M5A8F1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVH48-1M5A8F1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVH48-1M5A8F1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ERVH48-1M5A8F1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVH48-1M5A8F1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ERVH48-1M5A8F1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ERVH48-1M5A8F1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVH48-1M5A8F1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ERVH48-1M5A8F1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ERVH48-1M5A8F1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVH48-1M5A8F1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERVH48-1M5A8F1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVH48-1M5A8F1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERVH48-1M5A8F1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVH48-1M5A8F1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVH48-1M5A8F1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERVH48-1M5A8F1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERVH48-1M5A8F1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERVH48-1M5A8F1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVH48-1M5A8F1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVH48-1M5A8F1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERVH48-1M5A8F1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVH48-1M5A8F1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERVH48-1M5A8F1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERVH48-1M5A8F1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ERVH48-1M5A8F1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVH48-1M5A8F1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ERVH48-1M5A8F1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ERVH48-1M5A8F1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
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