Protein–RNA interactions for Protein: H0YIS7

RNASEK-C17orf49, RNASEK-C17orf49 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEK-C17orf49H0YIS7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNASEK-C17orf49H0YIS7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNASEK-C17orf49H0YIS7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RNASEK-C17orf49H0YIS7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNASEK-C17orf49H0YIS7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNASEK-C17orf49H0YIS7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RNASEK-C17orf49H0YIS7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNASEK-C17orf49H0YIS7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNASEK-C17orf49H0YIS7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RNASEK-C17orf49H0YIS7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNASEK-C17orf49H0YIS7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNASEK-C17orf49H0YIS7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RNASEK-C17orf49H0YIS7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNASEK-C17orf49H0YIS7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNASEK-C17orf49H0YIS7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RNASEK-C17orf49H0YIS7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNASEK-C17orf49H0YIS7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNASEK-C17orf49H0YIS7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNASEK-C17orf49H0YIS7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNASEK-C17orf49H0YIS7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNASEK-C17orf49H0YIS7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNASEK-C17orf49H0YIS7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNASEK-C17orf49H0YIS7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNASEK-C17orf49H0YIS7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNASEK-C17orf49H0YIS7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNASEK-C17orf49H0YIS7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNASEK-C17orf49H0YIS7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNASEK-C17orf49H0YIS7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNASEK-C17orf49H0YIS7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNASEK-C17orf49H0YIS7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNASEK-C17orf49H0YIS7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNASEK-C17orf49H0YIS7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNASEK-C17orf49H0YIS7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNASEK-C17orf49H0YIS7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNASEK-C17orf49H0YIS7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNASEK-C17orf49H0YIS7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNASEK-C17orf49H0YIS7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNASEK-C17orf49H0YIS7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNASEK-C17orf49H0YIS7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNASEK-C17orf49H0YIS7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNASEK-C17orf49H0YIS7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNASEK-C17orf49H0YIS7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNASEK-C17orf49H0YIS7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNASEK-C17orf49H0YIS7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNASEK-C17orf49H0YIS7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNASEK-C17orf49H0YIS7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNASEK-C17orf49H0YIS7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNASEK-C17orf49H0YIS7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNASEK-C17orf49H0YIS7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNASEK-C17orf49H0YIS7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNASEK-C17orf49H0YIS7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RNASEK-C17orf49H0YIS7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNASEK-C17orf49H0YIS7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNASEK-C17orf49H0YIS7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNASEK-C17orf49H0YIS7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNASEK-C17orf49H0YIS7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNASEK-C17orf49H0YIS7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNASEK-C17orf49H0YIS7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNASEK-C17orf49H0YIS7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNASEK-C17orf49H0YIS7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNASEK-C17orf49H0YIS7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNASEK-C17orf49H0YIS7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RNASEK-C17orf49H0YIS7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RNASEK-C17orf49H0YIS7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNASEK-C17orf49H0YIS7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNASEK-C17orf49H0YIS7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNASEK-C17orf49H0YIS7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNASEK-C17orf49H0YIS7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNASEK-C17orf49H0YIS7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNASEK-C17orf49H0YIS7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEK-C17orf49H0YIS7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNASEK-C17orf49H0YIS7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNASEK-C17orf49H0YIS7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEK-C17orf49H0YIS7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNASEK-C17orf49H0YIS7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEK-C17orf49H0YIS7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEK-C17orf49H0YIS7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNASEK-C17orf49H0YIS7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEK-C17orf49H0YIS7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNASEK-C17orf49H0YIS7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEK-C17orf49H0YIS7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNASEK-C17orf49H0YIS7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNASEK-C17orf49H0YIS7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNASEK-C17orf49H0YIS7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNASEK-C17orf49H0YIS7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEK-C17orf49H0YIS7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNASEK-C17orf49H0YIS7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms