Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.2
E9PCH4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
E9PCH4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
E9PCH4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
E9PCH4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
E9PCH4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
E9PCH4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
E9PCH4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
E9PCH4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
E9PCH4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
E9PCH4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
E9PCH4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
E9PCH4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
E9PCH4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
E9PCH4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
E9PCH4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.14■■■■■ 4.18
E9PCH4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
E9PCH4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
E9PCH4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
E9PCH4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
E9PCH4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
E9PCH4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
E9PCH4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
E9PCH4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
E9PCH4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
E9PCH4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
E9PCH4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
E9PCH4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
E9PCH4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.01■■■■■ 4.16
E9PCH4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
E9PCH4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
E9PCH4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
E9PCH4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
E9PCH4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.94■■■■■ 4.15
E9PCH4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
E9PCH4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.91■■■■■ 4.14
E9PCH4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
E9PCH4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
E9PCH4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
E9PCH4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
E9PCH4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
E9PCH4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
E9PCH4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.76■■■■■ 4.12
E9PCH4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.76■■■■■ 4.12
E9PCH4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
E9PCH4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
E9PCH4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
E9PCH4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
E9PCH4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
E9PCH4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
E9PCH4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
E9PCH4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
E9PCH4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
E9PCH4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC40.69■■■■■ 4.1
E9PCH4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
E9PCH4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
E9PCH4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
E9PCH4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
E9PCH4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
E9PCH4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
E9PCH4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
E9PCH4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
E9PCH4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
E9PCH4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
E9PCH4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
E9PCH4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
E9PCH4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
E9PCH4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
E9PCH4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
E9PCH4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
E9PCH4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
E9PCH4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
E9PCH4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
E9PCH4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
E9PCH4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
E9PCH4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
E9PCH4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
E9PCH4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
E9PCH4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
E9PCH4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
E9PCH4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
E9PCH4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
E9PCH4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
E9PCH4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.41■■■■■ 4.06
E9PCH4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
E9PCH4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
E9PCH4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
E9PCH4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
E9PCH4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
E9PCH4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
E9PCH4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
E9PCH4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC40.33■■■■■ 4.05
E9PCH4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
E9PCH4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
E9PCH4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
E9PCH4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
E9PCH4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
E9PCH4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
E9PCH4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
E9PCH4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms