Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B8ZZF3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
B8ZZF3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
B8ZZF3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
B8ZZF3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
B8ZZF3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
B8ZZF3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
B8ZZF3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
B8ZZF3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
B8ZZF3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
B8ZZF3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
B8ZZF3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
B8ZZF3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
B8ZZF3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
B8ZZF3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
B8ZZF3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
B8ZZF3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
B8ZZF3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
B8ZZF3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
B8ZZF3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
B8ZZF3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
B8ZZF3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
B8ZZF3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
B8ZZF3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
B8ZZF3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
B8ZZF3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
B8ZZF3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
B8ZZF3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
B8ZZF3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
B8ZZF3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
B8ZZF3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
B8ZZF3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
B8ZZF3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
B8ZZF3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
B8ZZF3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
B8ZZF3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
B8ZZF3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
B8ZZF3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
B8ZZF3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
B8ZZF3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
B8ZZF3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
B8ZZF3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
B8ZZF3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
B8ZZF3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
B8ZZF3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
B8ZZF3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B8ZZF3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
B8ZZF3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
B8ZZF3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
B8ZZF3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
B8ZZF3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B8ZZF3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
B8ZZF3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
B8ZZF3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
B8ZZF3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B8ZZF3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
B8ZZF3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
B8ZZF3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
B8ZZF3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B8ZZF3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
B8ZZF3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
B8ZZF3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
B8ZZF3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
B8ZZF3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
B8ZZF3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
B8ZZF3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
B8ZZF3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
B8ZZF3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
B8ZZF3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
B8ZZF3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
B8ZZF3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
B8ZZF3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
B8ZZF3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
B8ZZF3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
B8ZZF3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B8ZZF3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B8ZZF3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
B8ZZF3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
B8ZZF3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
B8ZZF3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
B8ZZF3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
B8ZZF3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
B8ZZF3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
B8ZZF3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
B8ZZF3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
B8ZZF3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
B8ZZF3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
B8ZZF3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
B8ZZF3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
B8ZZF3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
B8ZZF3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
B8ZZF3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
B8ZZF3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
B8ZZF3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B8ZZF3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
B8ZZF3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B8ZZF3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B8ZZF3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
B8ZZF3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
B8ZZF3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B8ZZF3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms