Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH2

KDM4E, Lysine-specific demethylase 4E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4EB2RXH2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4EB2RXH2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM4EB2RXH2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM4EB2RXH2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4EB2RXH2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM4EB2RXH2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM4EB2RXH2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM4EB2RXH2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KDM4EB2RXH2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4EB2RXH2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KDM4EB2RXH2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4EB2RXH2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KDM4EB2RXH2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KDM4EB2RXH2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KDM4EB2RXH2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM4EB2RXH2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KDM4EB2RXH2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4EB2RXH2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KDM4EB2RXH2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KDM4EB2RXH2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4EB2RXH2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KDM4EB2RXH2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4EB2RXH2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KDM4EB2RXH2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4EB2RXH2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDM4EB2RXH2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM4EB2RXH2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM4EB2RXH2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM4EB2RXH2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM4EB2RXH2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4EB2RXH2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4EB2RXH2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM4EB2RXH2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4EB2RXH2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4EB2RXH2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM4EB2RXH2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDM4EB2RXH2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDM4EB2RXH2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4EB2RXH2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4EB2RXH2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4EB2RXH2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4EB2RXH2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4EB2RXH2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4EB2RXH2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4EB2RXH2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM4EB2RXH2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM4EB2RXH2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4EB2RXH2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM4EB2RXH2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4EB2RXH2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4EB2RXH2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM4EB2RXH2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM4EB2RXH2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM4EB2RXH2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM4EB2RXH2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM4EB2RXH2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM4EB2RXH2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4EB2RXH2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms