Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
C5orf60A6NFR6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
C5orf60A6NFR6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C5orf60A6NFR6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C5orf60A6NFR6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C5orf60A6NFR6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C5orf60A6NFR6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C5orf60A6NFR6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C5orf60A6NFR6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
C5orf60A6NFR6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C5orf60A6NFR6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C5orf60A6NFR6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C5orf60A6NFR6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C5orf60A6NFR6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C5orf60A6NFR6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C5orf60A6NFR6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C5orf60A6NFR6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C5orf60A6NFR6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C5orf60A6NFR6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
C5orf60A6NFR6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C5orf60A6NFR6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C5orf60A6NFR6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C5orf60A6NFR6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C5orf60A6NFR6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C5orf60A6NFR6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C5orf60A6NFR6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C5orf60A6NFR6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C5orf60A6NFR6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C5orf60A6NFR6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C5orf60A6NFR6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C5orf60A6NFR6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C5orf60A6NFR6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C5orf60A6NFR6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C5orf60A6NFR6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C5orf60A6NFR6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C5orf60A6NFR6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C5orf60A6NFR6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C5orf60A6NFR6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C5orf60A6NFR6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C5orf60A6NFR6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C5orf60A6NFR6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C5orf60A6NFR6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C5orf60A6NFR6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C5orf60A6NFR6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C5orf60A6NFR6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C5orf60A6NFR6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C5orf60A6NFR6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C5orf60A6NFR6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C5orf60A6NFR6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C5orf60A6NFR6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C5orf60A6NFR6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C5orf60A6NFR6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C5orf60A6NFR6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C5orf60A6NFR6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C5orf60A6NFR6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C5orf60A6NFR6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C5orf60A6NFR6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C5orf60A6NFR6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C5orf60A6NFR6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
C5orf60A6NFR6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C5orf60A6NFR6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C5orf60A6NFR6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C5orf60A6NFR6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C5orf60A6NFR6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
C5orf60A6NFR6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C5orf60A6NFR6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C5orf60A6NFR6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C5orf60A6NFR6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C5orf60A6NFR6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C5orf60A6NFR6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C5orf60A6NFR6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C5orf60A6NFR6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
C5orf60A6NFR6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C5orf60A6NFR6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
C5orf60A6NFR6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C5orf60A6NFR6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C5orf60A6NFR6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C5orf60A6NFR6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C5orf60A6NFR6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C5orf60A6NFR6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C5orf60A6NFR6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
C5orf60A6NFR6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
C5orf60A6NFR6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C5orf60A6NFR6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C5orf60A6NFR6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms