Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
A4D1N5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
A4D1N5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4D1N5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
A4D1N5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
A4D1N5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4D1N5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4D1N5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
A4D1N5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
A4D1N5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4D1N5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
A4D1N5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
A4D1N5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
A4D1N5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
A4D1N5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
A4D1N5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
A4D1N5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
A4D1N5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
A4D1N5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4D1N5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4D1N5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4D1N5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
A4D1N5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4D1N5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
A4D1N5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
A4D1N5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
A4D1N5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4D1N5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
A4D1N5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4D1N5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
A4D1N5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
A4D1N5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A4D1N5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A4D1N5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4D1N5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4D1N5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A4D1N5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A4D1N5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4D1N5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4D1N5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A4D1N5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4D1N5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4D1N5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A4D1N5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
A4D1N5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
A4D1N5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
A4D1N5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
A4D1N5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
A4D1N5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
A4D1N5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
A4D1N5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
A4D1N5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
A4D1N5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
A4D1N5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
A4D1N5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
A4D1N5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4D1N5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
A4D1N5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4D1N5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4D1N5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4D1N5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4D1N5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
A4D1N5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4D1N5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4D1N5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
A4D1N5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
A4D1N5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4D1N5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4D1N5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4D1N5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
A4D1N5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4D1N5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4D1N5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4D1N5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
A4D1N5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4D1N5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4D1N5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
A4D1N5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4D1N5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
A4D1N5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
A4D1N5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4D1N5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
A4D1N5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
A4D1N5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4D1N5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4D1N5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4D1N5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
A4D1N5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4D1N5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4D1N5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4D1N5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4D1N5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
A4D1N5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4D1N5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4D1N5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
A4D1N5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4D1N5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
A4D1N5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4D1N5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
A4D1N5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms