Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
E2F8A0AVK6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
E2F8A0AVK6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
E2F8A0AVK6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
E2F8A0AVK6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E2F8A0AVK6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
E2F8A0AVK6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
E2F8A0AVK6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E2F8A0AVK6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
E2F8A0AVK6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
E2F8A0AVK6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
E2F8A0AVK6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
E2F8A0AVK6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
E2F8A0AVK6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
E2F8A0AVK6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E2F8A0AVK6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
E2F8A0AVK6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
E2F8A0AVK6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
E2F8A0AVK6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
E2F8A0AVK6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
E2F8A0AVK6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
E2F8A0AVK6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
E2F8A0AVK6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
E2F8A0AVK6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
E2F8A0AVK6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
E2F8A0AVK6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
E2F8A0AVK6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
E2F8A0AVK6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
E2F8A0AVK6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
E2F8A0AVK6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
E2F8A0AVK6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
E2F8A0AVK6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
E2F8A0AVK6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
E2F8A0AVK6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
E2F8A0AVK6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
E2F8A0AVK6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
E2F8A0AVK6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
E2F8A0AVK6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
E2F8A0AVK6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
E2F8A0AVK6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
E2F8A0AVK6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
E2F8A0AVK6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E2F8A0AVK6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
E2F8A0AVK6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E2F8A0AVK6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
E2F8A0AVK6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
E2F8A0AVK6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
E2F8A0AVK6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
E2F8A0AVK6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
E2F8A0AVK6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
E2F8A0AVK6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
E2F8A0AVK6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
E2F8A0AVK6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
E2F8A0AVK6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
E2F8A0AVK6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
E2F8A0AVK6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
E2F8A0AVK6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
E2F8A0AVK6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
E2F8A0AVK6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
E2F8A0AVK6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
E2F8A0AVK6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
E2F8A0AVK6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
E2F8A0AVK6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
E2F8A0AVK6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
E2F8A0AVK6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
E2F8A0AVK6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
E2F8A0AVK6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
E2F8A0AVK6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
E2F8A0AVK6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
E2F8A0AVK6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
E2F8A0AVK6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
E2F8A0AVK6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
E2F8A0AVK6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
E2F8A0AVK6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
E2F8A0AVK6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
E2F8A0AVK6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
E2F8A0AVK6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
E2F8A0AVK6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
E2F8A0AVK6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
E2F8A0AVK6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
E2F8A0AVK6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
E2F8A0AVK6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
E2F8A0AVK6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
E2F8A0AVK6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
E2F8A0AVK6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
E2F8A0AVK6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
E2F8A0AVK6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
E2F8A0AVK6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
E2F8A0AVK6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
E2F8A0AVK6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
E2F8A0AVK6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
E2F8A0AVK6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
E2F8A0AVK6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
E2F8A0AVK6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
E2F8A0AVK6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
E2F8A0AVK6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
E2F8A0AVK6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
E2F8A0AVK6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
E2F8A0AVK6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
E2F8A0AVK6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms