Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PPE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PPE3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A1W2PPE3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PPE3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PPE3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PPE3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PPE3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A1W2PPE3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PPE3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A1W2PPE3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PPE3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PPE3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A1W2PPE3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A1W2PPE3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A1W2PPE3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PPE3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PPE3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
A0A1W2PPE3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
A0A1W2PPE3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PPE3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
A0A1W2PPE3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
A0A1W2PPE3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPE3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
A0A1W2PPE3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPE3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
A0A1W2PPE3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
A0A1W2PPE3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPE3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
A0A1W2PPE3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
A0A1W2PPE3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
A0A1W2PPE3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PPE3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PPE3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
A0A1W2PPE3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
A0A1W2PPE3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PPE3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
A0A1W2PPE3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PPE3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
A0A1W2PPE3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PPE3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
A0A1W2PPE3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A1W2PPE3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPE3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPE3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A1W2PPE3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A1W2PPE3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPE3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPE3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPE3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A1W2PPE3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPE3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A1W2PPE3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A1W2PPE3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms